利用微波殺菌已應(yīng)用于食品制冷保鮮工業(yè)生產(chǎn)，如蘑菇小包裝、熟食品蔬菜、飲料小包裝、方便食品，用微波對(duì)啤酒采用中高功率殺菌后，菌落總數(shù)小于14個(gè)/mL，大腸菌群未檢出，都符合GB 4927-1985(菌落總數(shù)和大腸菌群數(shù)分別小于50個(gè)/mL和3個(gè)/mL)。對(duì)月餅的霉菌經(jīng)微波照射30s，溫度僅升高54.41，根本達(dá)不到霉菌的熱致死點(diǎn)(一般霉菌的熱致死點(diǎn)為62.5℃)，但對(duì)霉菌的殺滅率已達(dá)70%，這說(shuō)明微波殺菌有非熱效應(yīng)存在，實(shí)驗(yàn)證實(shí)經(jīng)微波照射2min，對(duì)曲霉的殺滅率達(dá)100%，對(duì)青霉的殺滅率達(dá)99.99%，同時(shí)，微波具有作用時(shí)間短、升溫快和殺菌效果好的優(yōu)點(diǎn)，利用微波對(duì)魚丸、魚片、熏魚、醬油、香腸、牛肉干、火腿及糕點(diǎn)等數(shù)十種物料進(jìn)行處理，證實(shí)微波對(duì)食品滅菌具有一定的非熱作用。還發(fā)現(xiàn)醬油經(jīng)微波處理后，可抑制霉菌的生長(zhǎng)及殺滅腸道致病菌，但對(duì)氨基酸態(tài)氮無(wú)破壞作用。

此外，用微波對(duì)牛奶殺菌消毒后，細(xì)菌和大腸桿菌數(shù)完全達(dá)到衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)要求，不僅營(yíng)養(yǎng)成分保持不變，而且脂肪球直徑變小，提高了產(chǎn)品的穩(wěn)定性，有利于人體消化和吸收。

對(duì)食品包裝用紙消毒，如用微波對(duì)質(zhì)量3掩、體積為15cm×12cm × 25cm的冰棍紙和60g糖紙殺菌，僅用5s即能殺滅包括紙面表層的微生物，無(wú)菌實(shí)驗(yàn)也證明效果是好的。

另外，微波和紫外線有協(xié)同殺菌作用，其作用明顯優(yōu)于單獨(dú)采用微波殺菌或紫外線殺菌的作用。